АТЛАС ГЕНЕТИЧЕСКИХ СВЯЗЕЙ
Каждая карточка отвечает на пять вопросов: что связано, насколько надёжно, можно ли измерить, меняет ли это решение и где заканчивается знание.
Источники и ссылки проверены редакционно. У каждой связи отдельно показаны уровень доказательности, применимость, метод исследования и предел вывода.
LDLR
Патогенные варианты могут нарушать удаление LDL-холестерина из крови.
Предел: Не каждый повышенный LDL объясняется LDLR; вариант неопределённого значения не подтверждает диагноз.
Разобрать связьCFTR
Два вызывающих заболевание варианта CFTR, обычно расположенные в разных копиях гена (in trans), могут приводить к муковисцидозу; проявления зависят от конкретных вариантов.
Предел: Один вариант чаще означает носительство, а не заболевание; интерпретация требует фенотипа и фазы вариантов.
Разобрать связьHBB
Клинически значимые варианты HBB изменяют структуру или количество β-глобина.
Предел: Сухой список SNP без гемоглобинового и клинического контекста недостаточен.
Разобрать связьHTT
Расширение CAG-повторов выше клинических порогов связано с заболеванием.
Предел: Тест может предсказать высокий риск заболевания, но не точный возраст начала и индивидуальное течение.
Разобрать связьBRCA1
Патогенные варианты повышают риск ряда опухолей, особенно молочной железы и яичников.
Предел: Положительный результат не означает неизбежность рака; отрицательный не обнуляет популяционный и семейный риск.
Разобрать связьBRCA2
Патогенные варианты повышают риски нескольких опухолей у людей разных полов.
Предел: Риски зависят от пола, возраста, семейного анамнеза и конкретного варианта.
Разобрать связьPALB2
Патогенные герминальные варианты повышают риск рака молочной железы и могут быть важны при других опухолях, включая рак поджелудочной железы.
Предел: Опухолевый вариант не доказывает наследственное происхождение, а VUS не является основанием для профилактической операции или таргетной терапии.
Разобрать связьMLH1
Патогенные герминальные варианты нарушают репарацию неспаренных оснований и повышают риск колоректального, эндометриального и ряда других раков.
Предел: Потеря MLH1/PMS2 в опухоли не равна синдрому Линча: возможно спорадическое гиперметилирование промотора MLH1.
Разобрать связьMSH2
Патогенные варианты MSH2, а также некоторые делеции EPCAM, могут выключать систему mismatch repair и повышать риск нескольких опухолей.
Предел: MSI-H/dMMR в опухоли является терапевтическим биомаркером, но само по себе не доказывает наследственный синдром.
Разобрать связьMSH6
Патогенные герминальные варианты повышают риск Lynch-ассоциированных опухолей, при этом спектр и возрастные риски отличаются от MLH1/MSH2.
Предел: Нормальный IHC не исключает все патогенные варианты; VUS не подтверждает синдром.
Разобрать связьPMS2
Патогенные герминальные варианты повышают риск рака, обычно с иной пенетрантностью, чем MLH1/MSH2.
Предел: Упрощённая панель или экзом могут ненадёжно покрывать отдельные экзоны PMS2.
Разобрать связьTP53
Конституциональные патогенные варианты TP53 связаны с широким спектром опухолей и ранним возрастом их возникновения.
Предел: Низкая доля варианта TP53 в крови не всегда означает наследственный синдром; нужен разбор источника варианта.
Разобрать связьCDH1
Патогенные герминальные варианты связаны с риском диффузного рака желудка и долькового рака молочной железы.
Предел: Не каждый рак желудка и не каждый вариант CDH1 относится к этому синдрому.
Разобрать связьPTEN
Патогенные герминальные варианты связаны с гамартомами и повышенными рисками нескольких опухолей.
Предел: Соматическая потеря PTEN в опухоли не равна герминальному синдрому.
Разобрать связьSTK11
Патогенные герминальные варианты связаны с характерными полипами, пигментацией и повышенными рисками опухолей.
Предел: Соматическая мутация STK11 в раке лёгкого имеет другой смысл и не подтверждает синдром Пейтца—Егерса.
Разобрать связьRET
Активирующие герминальные варианты RET связаны с медуллярным раком щитовидной железы и MEN2; риск зависит от конкретного кодона.
Предел: Нельзя смешивать герминальную активирующую замену RET и приобретённое RET-слияние в опухоли.
Разобрать связьAPC
Патогенные варианты могут вызывать семейный аденоматозный полипоз и связанные фенотипы.
Предел: Нормальный потребительский SNP-тест не исключает синдром.
Разобрать связьPKD1
Патогенные варианты — частая причина ADPKD; ген технически сложен из-за псевдогенов.
Предел: Не всякая панель или экзом одинаково надёжно покрывает PKD1.
Разобрать связьFBN1
Патогенные варианты FBN1 связаны со спектром признаков соединительной ткани.
Предел: Выраженность сильно варьирует даже внутри семьи.
Разобрать связьTTR
Патогенные варианты могут приводить к амилоидной полинейропатии и/или кардиомиопатии.
Предел: Возраст проявления и поражённые органы различаются; носительство не равно текущему заболеванию.
Разобрать связьCYP2C19
Некоторые аллели снижают образование активного метаболита клопидогрела.
Предел: Не меняйте препарат или дозу самостоятельно; клиническая ситуация важнее одного генотипа.
Разобрать связьSLCO1B1
Функция транспортёра влияет на экспозицию некоторых статинов и риск мышечных симптомов.
Предел: Не объясняет все мышечные симптомы и не заменяет оценку взаимодействий лекарств.
Разобрать связьHLA-B
Аллель HLA-B*57:01 связан с высоким риском гиперчувствительности к абакавиру.
Предел: Отрицательный результат не исключает все возможные лекарственные реакции.
Разобрать связьTPMT
Сниженная активность TPMT повышает риск тяжёлой миелосупрессии при стандартных дозах тиопуринов.
Предел: Не отменяет влияние NUDT15, лекарственных взаимодействий и клинического мониторинга.
Разобрать связьNUDT15
Сниженная функция NUDT15 связана с непереносимостью тиопуринов, особенно значима в ряде популяций.
Предел: Ограниченная панель может пропустить редкие функциональные варианты.
Разобрать связьDPYD
Сниженная активность DPD может повышать риск тяжёлой токсичности фторпиримидинов.
Предел: Панель частых вариантов не выявляет все причины дефицита DPD.
Разобрать связьHERC2
Регуляторные варианты рядом с OCA2 объясняют заметную долю вариации цвета глаз в изученных популяциях.
Предел: Точность зависит от происхождения и модели; один SNP не описывает внешность человека.
Разобрать связьMCM6
Регуляторные варианты в MCM6 связаны с сохранением активности лактазы у взрослых в некоторых популяциях.
Предел: Не диагностирует все причины непереносимости молочных продуктов.
Разобрать связьMC1R
Несколько функциональных вариантов заметно меняют соотношение эумеланина и феомеланина и вероятность рыжих волос в ряде популяций.
Предел: Вариант не определяет оттенок волос, кожи, число веснушек или индивидуальный риск рака кожи сам по себе.
Разобрать связьABCC11
Вариант rs17822931 оказывает необычно сильное влияние на сухой/влажный тип ушной серы и продукцию пахучих компонентов пота.
Предел: Гигиенические привычки, микробиом кожи и восприятие запаха не определяются одним вариантом.
Разобрать связьTAS2R38
Гаплотипы PAV/AVI заметно влияют на порог восприятия PTC и PROP.
Предел: Предпочтение кофе, овощей или сладкого зависит от культуры, опыта, возраста и множества рецепторов.
Разобрать связьALDH2
Снижающий функцию вариант rs671 может приводить к накоплению ацетальдегида, покраснению и неприятным симптомам после алкоголя.
Предел: Отсутствие rs671 не делает алкоголь безопасным и не исключает покраснение по другим причинам.
Разобрать связьACTN3
Вариант R577X изучался в связи с силовыми и скоростными характеристиками, но эффект мал, неоднороден и не определяет талант.
Предел: Коммерческий ярлык «спринтер» или «марафонец» превышает доказательства.
Разобрать связьAPOE
Аллели APOE связаны с изменением относительного риска и возраста начала, но не определяют судьбу человека.
Предел: Риск сильно зависит от возраста, происхождения, семейного и сосудистого контекста; тестирование несовершеннолетних без показаний неэтично.
Разобрать связьFOXO3
Некоторые варианты повторно ассоциировались с долголетием, но эффект мал и популяционно неоднороден.
Предел: Нельзя переводить небольшую групповую ассоциацию в обещание дополнительных лет жизни.
Разобрать связьДОПОЛНИТЕЛЬНЫЙ МОДУЛЬ
Отдельная карта объясняет, где генетика даёт клинически значимый результат, а где тесты способностей и таланта превышают доказательства. Внутри — специальный раздел о детях.
Открыть модуль →