РЕДКИЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ / ПЕРВАЯ ВЕРСИЯ 0.12

Редкое заболевание — это клиническая задача. Не название теста.

Панель, CMA, экзом и геном видят разные классы изменений. Здесь можно сравнить их роль, ограничения и место реанализа — без анкеты симптомов, диагноза по форме или автоматического заказа исследования.

01Клиническая задача
02Что уже известно
РЕДКИЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ · КАРТА МЕТОДОВ

Результат проверки

После закрытия все поля и результат очищаются. Не заказывайте исследование только по этой странице: выбор зависит от полного фенотипа, типа наследования, уже выполненных методов и доступности клинической лаборатории.

КАРТА МЕТОДОВ

Шесть инструментов. Шесть разных границ.

Это не линейка от «хуже» к «лучше». Метод оценивают по клиническому вопросу, ожидаемому классу вариантов, образцу, покрытию и уже выполненным исследованиям.

01НЕ УНИВЕРСАЛЬНЫЙ ТЕСТ

Адресный семейный вариант

ЧТО ПРОВЕРЯЕТ
Проверяет заранее известный точный вариант из подтверждённого семейного отчёта.
ГЛАВНАЯ ГРАНИЦА
Не заменяет широкий поиск причины и не работает по одному названию гена, пересказу или VUS.
02НЕ УНИВЕРСАЛЬНЫЙ ТЕСТ

Один ген / панель

ЧТО ПРОВЕРЯЕТ
Фокусирует анализ на конкретной гипотезе или группе генов с похожим фенотипом.
ГЛАВНАЯ ГРАНИЦА
Состав и техническое покрытие различаются; больше генов не означает более подходящий тест.
03НЕ УНИВЕРСАЛЬНЫЙ ТЕСТ

CMA

ЧТО ПРОВЕРЯЕТ
Ищет потери и приобретения участков генома — CNV — на заданном разрешении.
ГЛАВНАЯ ГРАНИЦА
Обычно не отвечает на большинство однонуклеотидных вариантов и малых indel.
04НЕ УНИВЕРСАЛЬНЫЙ ТЕСТ

Клинический экзом

ЧТО ПРОВЕРЯЕТ
Анализирует преимущественно кодирующие области множества генов; может быть полезен при широкой гетерогенности.
ГЛАВНАЯ ГРАНИЦА
Покрытие неравномерно; повторы, часть CNV/SV, мозаицизм и некодирующие варианты могут потребовать другого метода.
05НЕ УНИВЕРСАЛЬНЫЙ ТЕСТ

Клинический геном

ЧТО ПРОВЕРЯЕТ
Охватывает кодирующие и некодирующие области и может объединять несколько классов вариантов.
ГЛАВНАЯ ГРАНИЦА
Широкий охват не гарантирует интерпретируемость; возможности конкретной лаборатории и класса вариантов надо проверять.
06НЕ УНИВЕРСАЛЬНЫЙ ТЕСТ

Реанализ

ЧТО ПРОВЕРЯЕТ
Повторно оценивает данные или отчёт с новыми знаниями о генах, вариантах и изменившемся фенотипе.
ГЛАВНАЯ ГРАНИЦА
Реанализ не исправляет вариант, который исходный метод технически не мог обнаружить.

КЛИНИЧЕСКАЯ ЛОГИКА

Фенотип → метод → результат → переоценка.

  1. 01

    Структурировать фенотип

    Не список жалоб в интернете, а клинические признаки, возраст начала, обследования и родословная, собранные профильной командой.

  2. 02

    Определить классы вариантов

    SNV/indel, CNV, структурные варианты, повторы, мозаицизм, митохондриальная ДНК и метилирование требуют разных аналитических возможностей.

  3. 03

    Проверить отчёт, а не только ответ

    Нужны метод, покрытие, геномная сборка, транскрипт, классификация, связь ген–заболевание и ограничения отрицательного результата.

  4. 04

    Вернуться к вопросу после результата

    VUS — не диагноз. Отрицательный результат — не исключение. Реанализ полезен только с пониманием того, что исходный метод действительно измерял.