1. Преаналитика — часть результата
Тип биоматериала, время фиксации, доля опухолевых клеток, некроз и возраст блока меняют чувствительность. В плазме количество ctDNA зависит от опухолевой нагрузки и биологии метастазов. Поэтому «не найдено» без описания образца почти неинтерпретируемо.
2. Один NGS не видит всё одинаково
Короткие варианты, крупные перестройки, амплификации, слияния, MSI, TMB и HRD требуют разных аналитических решений. RNA-секвенирование часто сильнее для слияний; IHC/ISH остаются стандартом для ряда белковых и амплификационных биомаркеров.
3. Находка должна быть точной
Нужны HGVS-описание, сборка генома, аллельная доля, покрытие, копийность или точное название слияния; партнёры и точки разрыва указывают, когда метод способен их определить. «EGFR+», «BRCA-мутирован» или «HER2 изменён» недостаточно: разные варианты одного гена могут означать чувствительность, резистентность, наследственный риск или отсутствие доказанного действия.
4. Доказательство ранжируют, а не угадывают
AMP/ASCO/CAP классифицирует клиническую значимость соматических вариантов, а ESCAT ранжирует применимость мишени. Опора на одобрение в другой опухоли, единичный кейс или доклиническую модель должна быть помечена слабее, чем рандомизированные данные в том же показании.
5. Биомаркер не назначает препарат
Решение зависит от морфологии, стадии, линии, предыдущего лечения, общего состояния, функций органов, взаимодействий, доступности и актуальной регистрации. Конфликтующие сигналы и редкие варианты лучше обсуждать на молекулярном опухолевом консилиуме.
6. Отрицательный результат тоже имеет границы
В отчёте должно быть видно, что именно исключено при данной чувствительности. Неинформативная ctDNA требует тканевого рефлекса, если это возможно. Повторная биопсия может понадобиться после эволюции опухоли, но только когда результат способен изменить безопасное решение.